A Cotrijui está realizando um projeto de Fertilização in vitro em parceria com a empresa In Vitro Brasil. O objetivo da FIV (Fertilização In Vitro) é o melhoramento de animais geneticamente superiores. Esta técnica tem como grande vantagem a rapidez do ganho genético de até 5 gerações em apenas um trabalho, isto é, enquanto que com a Inseminação Artificial (IA) demoraríamos 5 gerações inseminando para termos um animal com alta qualidade, já na primeira geração de produtos oriundos de FIV é obtida essa condição. O principal desafio desses primeiros trabalhos com os cooperados da COTRIJUI foi de congelar os embriões para que os produtores tenham uma reserva para épocas estratégicas como verão, onde os índices de concepção da inseminação artificial caem. Isso ocorre devido estresse térmico das vacas. Enquanto isso, as taxas de concepção dos embriões tendem a permanecer com índice normal ao longo do ano. No caso da Cotrijui o trabalho de campo já foi implementado junto as propriedades dos seguintes associados: Alcio Wrasse, Ederson Gehrcke, Claudivan Muller, Valmir Posselt, Sergio Brisma, Elton Mensch, Olavo Antoniazzi e Cesar Gatelli. Os primeiros bezerros de FIV (fertilização in vitro) nascem a partir de fevereiro de 2015. A efetivação dos procedimentos vem sendo feita periodicamente e novos produtores estão aderindo ao programa de melhoramento genético.