O Departamento Comercial da Cotrijui trabalha com ênfase o programa Mútuo de Sementes. Nos últimos dias acelera-se o processo para a comercialização de sementes de trigo (visando a safra de inverno) e também com projeções de soja para a safra de verão. As formas de acordo podem ser conferidas pessoalmente pelos associados da Cooperativa nas respectivas unidades.