É imperioso deixar claro aos associados e demais interessados, que, ao assumir o comando da Cotrijui, a atual Diretoria deparou-se com antecipações de valores efetuados pelos antigos gestores com a venda de soja, com montante que supera aos 80 milhões de reais. Ainda, pelo procedimento implementado na época, esses 80 milhões deveriam ser pagos em 2013, não havendo provisão para tal. Esse fato pôs em risco a safra de verão deste ano, havendo, na época, o risco eminente de arresto por estes credores, o que criou embaraços no momento o recebimento de grãos pela Cotrijui. Posteriormente, pelo instrumento do armazém geral, o quadro mudou, mas a maioria dos associados já haviam optado por outros compradores. Isso será diferente já na safra de inverno (trigo) e será mais acentuado ainda na colheita de verão (milho e soja).
Igualmente, é necessário lembrar que ao assumir a Cooperativa, os dirigentes atuais depararam-se com salários dos funcionários e prestadores de serviço em atraso e sem recursos para o pagamento. Gradativamente, a nova Direção trabalhou e, mediante ajustes, vem pagando as pendências aos prestadores, além de manter os salários em dia. Outros fornecedores e parceiros que vivenciavam a mesma situação também vem tendo as pendências resolvidas.